Македонистите от Светския македонски конгрес си присвоиха и Желязната църква в Истанбул, като я обявиха за строена от македонци. В статия публикувана на страницата на македонистката организация ОМО Илинден Пирин от 18 август е изразено  становището на ултранационалистическата организация, която насажда убеждението,че независимо от това, че днес Желязната църква „Св.Стефан” е под юрисдикцията на Българската православна църква, един ден тя отново ще се държи от Македонската православна църква.

 В статията се твърди,че Желязната църква е македонска, защото е строена от македонците в Истанбул, с парите на македонските чорбаджии и в нея са служили много македонски епископи. Първоначално църквата била дървена,но гърците я палили, затова македонците поръчали от Австрия желязна църква. В двора й бил погребан според твърденията на македонистите последния дойрански епископ Партений Зографски, което било поредното доказателство,че е македонска,а не българска.

 Като контрапункт на националистическите напъни на македонистите можем да посочим изказването на българския премиер Бойко Борисов при тържественото освещаване на реставрираната църква.

В присъствието на президента Реджеп Таип Ердоган  българският премиер отправи послание,което остана малко страни от медийното внимание. Българският премиер изрично подчерта, че и Истанбул и София са пример за етническа толерантност и пример за подражание. Борисов бе категоричен, че изселническите общности не се ползват за натиск между двете страни. Не се ползва и мюсюлманското население у нас. Нещо повече,те са мост за сигурност и генерират толерантност.

  Светата  литургия в храма бе отслужена от Вселенския патриарх Вартоломей и българският патриарх Неофит.Не бяха забелязани македонски епископи,нито македонци,жители на Истанбул.За сметка на това обаче имаше представители на Българската екзархия и българската общност в мегаполиса.

Георги Кулов